朱亮祖的估計似乎是對的，過了一段時間，始終未見朱元璋有何反應，他終于安心了。
也正是因為這個原因，當大理寺的官員手持朱元璋的手諭來抓他時，朱亮祖才會那樣的吃驚。他雖然手下有兵，卻還沒有神經錯亂到敢于朱元璋對抗。他十分老實的把自己的兵權交出，和大理寺的官員一起前往京城請罪。
然而大理寺的官員并不急于上路，卻詢問他：“你的兒子朱暹呢？”
這下朱亮祖驚呆了，他明白這句話的含義。
因為朱元璋的人生哲學正是：要么不做，要么做絕 一路上，朱亮祖還存有幻想，他認為自己勞苦功高，只不過殺了一個知縣，朱元璋最多是責罰一下他而已，并不會殺他。
但現實和想象總是有差距的。
洪武十三年（公元1380）九月初三，朱亮祖與長子朱暹被押到了朱元璋的面前，朱元璋沒有跟他廢話，充分發揮了自己動手的精神，上來就用鞭子抽了朱亮祖。侍衛們一看皇帝親自上陣，士氣大振，在得到朱元璋默許后，紛紛開始動手。朱亮祖與他的兒子朱暹就這樣被活活鞭死。
“鞭死”二字，細細品位，實在讓人膽寒。
殺掉朱亮祖和朱暹后，朱元璋下令將參與此事的惡霸全部殺死。他念及朱亮祖有功，給他留了全尸，但其他人就沒有這么好運氣了，朱暹等人的皮都被剝了下來，懸掛在鬧市，供眾人參觀，以為后世警戒。
朱元璋對這件事情的處理讓很多官員膽戰心驚。而朱亮祖也在無意中創造了一個記錄：他是第一個被當廷打死的大臣。
不過他并不是最后一個。此后，當廷打死大臣這一明朝獨特的現象就此延續了下去。終明一朝，很多直言大臣都被這種極端的刑罰打掉了性命。
此后，朱元璋對待貪官污吏的態度越來越嚴厲，他創造了一個以往封建統治者想都不敢想的政策，即規定普通百姓只要發現貪官污吏，就可以把他們綁起來，送京治罪，而且路上各檢查站必須放行，如果有人敢于阻擋，不但要處死，還要株連九族！這在中國法制史上是絕無僅有的。
但這一政策的操作性不強，明代的實施者并不多。
與這種群眾檢舉揭發相比，朱元璋肅貪的主要線索來源是他的耳目，也就是我們上面介紹過的檢校。這些人遍布全國各地，一旦發現官員有貪贓枉法等問題即可上奏，而朱元璋也拿出了玩命的精神，即使情報送到京城已經是半夜，他也會立刻起床接見。
甚至有的貪官今天剛收紅包，第二天就會有紀檢官員來找他，并將他抓回論罪。其效率不可謂不高。
朱元璋使用了這么多的手段，自己也全力配合，按說貪污行為應該絕跡，然而情況遠沒有他想象的那么簡單。
朱元璋制定了法律，規定當時的刑罰限于笞、杖、徒、流、死五種，從字面上也很容易理解這五種刑罰，客觀來說，在封建社會這些刑罰并不算重。這也是朱元璋考慮到前朝的刑罰過重而做出的一種改進。
但朱元璋并不是個按規矩出牌的人，在對付貪官污吏和反對他的大臣上，他用的絕不是這幾招。
在他實施的刑罰中，最有名的莫過于凌遲，把人綁在柱子上，用刀慢慢割，如果行刑的人技術好，那受刑者就要受苦了，據說最高紀錄是割三千多刀，把肉都割完了人還沒死。
除此外，還有所謂抽腸（顧名思義）、刷洗（用開水澆人，然后用鐵刷子刷）、秤桿（用鐵鉤把人吊起風干）、閹割、挖膝蓋等等。
然而在這些令人生畏的死亡藝術前，官員們仍然前腐后繼，活像一群敢死隊，成群結隊地走到朱元璋的刑具下。
自明朝開國以來，貪污不斷，朱元璋殺不盡殺，據統計，因貪污受賄被殺死的官員有幾萬人，到洪武十九年（1386），全國十三個省從府到縣的官員很少能夠做到滿任，大部分都被殺掉了。在當時當官未必是件好事，能平平安安的活到退休就已經很不錯了，完全可以自豪的說一聲阿彌陀坲。
