病因:引起人發病的原因很多，《黃帝內經》將其歸納為二類。風雨寒暑實為“六淫“的概括;陰陽喜怒乃“七情“的概括;飲食居處即“飲食勞倦“。可以認為這就是后世三因說之濫觴。
2.發病:正邪雙方力量的對比，決定著疾病的發生與發展，這就是“正氣存內，邪不可干“之意。《素問·上古天真論》所說“精神內守，病安從來“，《素問·評熱病論》所說“邪之所湊，其氣必虛“等，都論證了這一點。
3.病變:疾病的變化是復雜的，《黃帝內經》概括病變也是多方面的，有從陰陽來概括的，用表里中外歸納的，用寒熱歸納的，從虛實而論者，實指邪氣盛，虛指正氣衰。概括說來，有正虛而邪實者，有邪實而正不虛者，有正虛而無實邪者，有正不虛而邪不實者。
折疊診法學說 望聞問切四診源于《黃帝內經》。
1.望診:包括觀神色、察形態、辨舌苔。
觀神色者，如《靈樞·五色》、《靈樞·五閱五使》和《靈樞·五色》所載，這些在臨床上都很有意義。
察形態者，是察看人的骨肉皮膚而推斷病情，在臨床上虛實是錯綜復雜的，只有知其常，才能達其變。
辨舌苔者，如《素問·熱論》、《素問·刺熱論》和《靈樞》所載等等。
2.聞診:包括聞聲和嗅氣味。
聞聲音者，是聽患者的聲音而診斷病情。
其次是嗅氣味，如《素問·金匱真言論》所說，肝病其臭臊，心病其臭焦，脾病其臭香，肺病其臭腥，腎病其臭腐。
3.問診:問訊患者的自覺癥狀，以診斷病情。
4.切診:包括切脈與切膚。《黃帝內經》言切脈最詳，主要為:
(1)三部九候法:即分頭手足三部，每部分天地人三候。
(2)人迎寸口脈法:即兼診人迎和寸口兩處之脈，互相比較。
(3)調息法:即調醫者之呼吸，診病人之脈候。
(4)謂胃氣脈:脈象之中有無胃氣，至關重要，有胃氣則生，無胃氣則死。
(5)六綱脈:《黃帝內經》所載脈象很多，如浮、沉、遲、數、虛、實、滑、澀、長、短、弦、細、微、濡、軟、弱、散、緩、牢、動、洪、伏、芤、革、促、結、代、大、小、急、堅、盛、躁、疾、搏、鉤、毛、石、營、喘等等。但常以六脈為綱加以概括。
其次是切膚:膚泛指全身肌膚，按肌膚而協助診斷的內容很多，如“按而循之“、“按而彈之“等等。但論之最詳細的是切尺膚。因為脈象與尺膚有必然的聯系，故診病時亦可互相配合。
折疊治則學說 研究治療法則的學說稱治則學說。
1.防微杜漸:包括未病先防和已病防變。如“春夏養陽、秋冬養陰“等皆言預防疾病，有病早治防其傳變。
2.因時、因地、因人制宜:
因時制宜者，是告誡醫者用藥勿犯四時寒熱溫涼之氣。
因地制宜者，在治療時不可一概而論，必須加以區別。而《素問·異法方宜論》論述東南西北中“一病而治各不同“的因地制宜甚詳，如東方之域，其治宜砭石;西方之域，治宜毒藥;北方之域，治宜灸祔;南方之域，治宜微針;中央之域，治宜導引按偁。
因人制宜者，如《素問·五常政大論》和《素問·征四失論》所載。
3.標本先后:即因病之主次而先后施治。有關標本先后施治的大法在《素問·標本病傳論》中敘述最詳。
4.治病求本:這是《黃帝內經》治則中最根本的一條。《素問·陰陽應象大論》說:“治病必求于本。“
5.因勢利導:在治病求本的基礎上巧妙地加以權變。
6.協調陰陽:此為治療之大法要義。
7.正治反治:正治亦稱逆治，是與病情相逆的直折的治療方法。比如“熱者寒之，寒者熱之，虛者補之，實者瀉之“之類;反治也稱從治，如“寒因寒用，熱因熱用，通因通用，塞因塞用“之類。
8.適事為度:無論扶正還是祛邪都應適度，對于虛實兼雜之癥，尤其應當審慎。切記“無盛盛，無虛虛“，即使用補，也不能過。
9.病為本，工為標:《素問·湯液醪醴論》指出:“病為本，工為標。“這是說病是客觀存在的，是本;醫生認識治療疾病，是標。醫生必須以病人為根據，這樣才能標本相得，治愈疾病。
10.辨證施治:《黃帝內經》雖未提出“辨證施治“一詞，卻有辨證施治之實。上述幾點均含此意，而書中已有臟腑辨證、經絡辨證、八綱辨證、六經辨證的內涵。
11.制方遣藥:《黃帝內經》雖載方藥無多，但其方藥之理已具。
12.針刺灸祔:《黃帝內經》言經絡、腧穴、針刺、灸祔者非常多，僅僅補瀉手法就有呼吸補瀉、方員補瀉 黃帝內經》接受了中國古代唯物的氣一元論的哲學思想，將人看作整個物質世界的一部分，宇宙萬物皆是由其原初物質“氣“形成的。在“人與天地相參“、“與日月相應“的觀念指導下，將人與自然緊密地聯系在一起。
一、“氣“是宇宙萬物的本原老子在《道德經》云:“有物混成，先天地生。寂兮寥兮，獨立而不改，周行而不殆，可以為天下母。“認為構成世界的原初物質是形而上者的“道“。宋钘、尹文將這種原初物質稱之為“氣“。《黃帝內經》受這些學說的影響，也認為“氣“是宇宙萬物的本原，“太虛寥廓，肇基化元，萬物資始，五運終天“。在天地未形成之先便有了氣，充滿太虛而運行不止，然后才生成宇宙萬物。這其實是揭示天體演化及生物發生等自然法則。在宇宙形成之先，就是太虛。太虛之中充滿著本元之氣，這些氣便是天地萬物化生的開始。由于氣的運動，從此便有了星河、七曜，有了陰陽寒暑，有了萬物。陰陽五行的運動，總統著大地的運動
