為了強加統治，大清就對題本制度進行了改革，自張廷玉把奏折制度化以后，稍微重要一點的事務，地方官員都先撰擬奏折，經過皇帝朱批，認可了，才寫題本作正式報告，作為奏事的依據。但奏折中的朱批內容，不得寫入題本，這樣題本就成了官樣文章，價值大大降低。
這樣其實就等于變相的削掉了內閣票擬的權力，奏折不經內閣直達御前，皇帝批復之后才在內閣那邊走一遍流程，內閣成了處理日常事務的衙門。
奏折代替了原來題本的作用，使它成為主要官方文書，這一制度堅持到清末。奏折剛產生時，有資格使用奏折的官員不太多，雍正踐祚之后，內苦于宗室諸王的訕謗排擠，外困于滿漢大臣的朋黨傾軋，急于求言，故放寬了臣民專折具奏的范圍和權限。
由于奏折所涉事情多系國家機密，所以奏折的保密性是非常突出的。不能保密，就不要上奏折，保密是書寫奏折的前提條件。
正是因為保密為前提，官員們給皇帝上奏折也安心，不用擔心被別人知道，然后被別人報復。
朱厚照看重的就是這一點，比如這一次的揚州案，如果有奏折的存在，那么朱厚照相信情況肯定不會崩壞到這個地步。其他的不說，這么多年了，揚州一個正直的官員都沒攤上？當然不會，只是他們有心無力罷了！上的題本估計都沒到御前，這個人就沒了，皇帝看到的東西也是經過漂沒的。
一旦有了奏折制度，那么內閣的權力將會得到很大的削弱，內閣權力的削弱代表著內閣首輔大學士權力的削弱。
雖然這看起來是一個衙門，或者是一個人幾個人的權力削弱，但是朱厚照知道，這絕不是，一旦削弱了內閣的權力，那就代表著整個文官團體的削弱，代表著皇權統治的加強。大清被稱為封建王朝的巔峰，并不是沒有道理的，他的很多制度都是非常有利于王朝統治的。
由于奏折免去了中間環節的傳遞，又采用廷寄方法，不但能迅速遞到皇帝手中，而且在皇帝朱批御旨后，又可直接發還上奏官員，馬上付諸實行，從而大大提高了行政效率。
由于奏折都是秘密進行，于是在直省督撫與司道之間，地方與中央，內廷與外廷之間，除正常的領導與被領導等關系之外，又形成了一種相互制約的關系。
大臣相互告密，皇帝的耳目遍布京內外，誰也不知道誰向皇帝打了什么小報告，中央部院和地方上的公私事件和人際關系，無論巨細，皇帝都可以從奏折中直接了解到。皇帝于是借助奏折整飭吏治，監察民情，發號施令，排斥異己，天下庶務總歸一人處理，從而使封建皇權到了無以復加的地步。
雍正皇帝是朱厚照唯一一個敬佩的清代皇帝，因為他的改革和他制定的制度，在很多方面都是開創性的。
朱佑樘聽著兒子將奏折的事情詳細的說了一遍，臉上的表情頓時變得很精彩，目光怪異的上下打量兒子，這權術之道，兒子玩的也是爐火純青，如此手段當真是頗為幾分漢高祖的意思，讓官員們互相告密，簡直就是要了這些官員的命了。
不說其他的，單單是官員之間的傾軋，那會造成多少人來回彈劾？下官覬覦上官的職位，會不會死盯著等著上官犯錯？
當然了，換一個角度想，那些正直的官員有了上書的通路，那豈不是很多事情都要好辦很多了？遇到什么事情上一份奏折，盡到了為臣子的本分，同時又不會傷害到自己，也不害怕被別人報復，多少人愿意做這樣的事情？朱佑樘不敢想象了。
“密折遞到哪里？”朱佑樘看著朱厚照，略微遲疑的問道：“這個問題你想過沒有？”
如果遞到司禮監，那么一旦遇到不喜歡上朝做事的皇帝，司禮監可是有為皇帝批紅的權力，密折到了他們手里會是什么后果？這一點朱佑樘想得到，朱厚照不可能想不到，真的將密折遞到司禮監，那么就等于削了內閣的權力轉而增強了司禮監的權力。
“回父皇，走通政司！”朱厚照想都沒想就說道，這個問題他其實早就想好了。
通政司現在的情況非常的慘，九卿里面地位十分的低下，可以說是非常非常難過的衙門，同時通政使沈祿是壽寧侯張鶴齡的人。以后不好說，但是這個人前期是有用的，至少他為了攫取權力不擇手段，可是先用起來，要知道密折的反抗力肯定也不小，尤其是幾位內閣大學士那邊。
“通政司？”朱佑樘苦笑著搖了搖頭：“通政司現在向漏勺一樣，進入那里的密折還是密折嗎？”
“通政司本就是上呈下達，密折走通政司正合適，同時通政司不牽扯到票擬，也不牽扯到批紅，對這雙方并沒有什么影響，同時也不會讓司禮監接觸到密折，而是由通政司直接呈遞到御前，至于保密的問題，兒臣準備在通政司這里密折處，專司各地呈遞密折。“朱厚照直接就把自己的構思給說了出來。
上下打量了一番兒子，朱佑樘直接問道：“這件事情你想了好久了吧？”
“回父皇，兒臣離京之前就在想這件事情了，坐在這紫禁城之中，最難得到的就是實情，想知道外面發生了什么，可以說是難上加難，當時兒臣就在想一個辦法。一旦有了密折，除了文官，各地的武將也可以上奏折到御前，這也是有利的。”朱厚照也沒否認，直接就點頭承認了。
看著兒子的臉，朱佑樘笑了，什么有利了，如果放開了各地武將的密折權限，那就等于提升了武將的地位，隨之提升的還有勛貴的地位。
雖然大家都看不起勛貴，可是勛貴在軍中的地位很高的，尤其是現在還沒經歷嘉靖朝，南京守備都是成國公，勛貴在軍中的勢力可以說盤根錯節，密折能讓他們更少的受到文官的控制，因為他們有反制的手段，可以彈劾文官，這樣一來，文官也不敢做的太過分。
