在長沙監軍的楊喬然決意仿效先祖楊再思的軍事體制，在城步縣周邊地區實行全民兼兵，和清軍打一場持久戰。于是他上書隆武帝，請求給他湖廣最高軍事統帥權力，言辭慷慨激昂，很切合實際，有助于南明軍隊的協調統一。
隆武帝遠在福州，對湖廣的局勢甚是關注，他看了奏折之后，很是欣賞楊喬然的忠心和勇氣，決心將城步縣建成為反清復明的基地，遂密令楊喬然回鄉祭祖，其實是準備在五嶺地區訓練一支新軍，直接受皇帝指揮和調度。
隆武二年(1646)五月，湖廣監軍監察御史楊喬然率軍親臨上官村再次祭掃祖塋，楊氏族人長老匯聚宗祠，為恢復大明江山獻計獻策。
為了穩定族人的情緒，楊喬然奉命特意從長沙省府用青石板刻制了一塊《察院》的石碑，將楊一元等31戶楊氏后裔定位“官戶”，享受縣府俸祿，免除地方差役、雜役等，這在寶慶府為首例。
楊喬然走到前廳，總覺得少了點什么，于是提筆書寫“派總關西”匾額，懸掛在前廳，一前一后正好呼應。
一個長老說：“喬然侄子，楊氏宗祠太普遍了，何不向皇上奏請將名字改一改呢？”
楊喬然想了想，有所頓悟：“好，那我就奏請皇上賜楊氏官廳，前輩以為如之何？”
長老作揖道：“楊氏官廳......這個好！它不僅是榮譽的象征、批閱官書的場所，更是湘、桂、黔、渝等地楊氏后裔認祖歸宗之地。”
楊喬然道:“幾百年了，早該如此。我向皇上寫個奏折就擺平了。”......
不久，南明隆武皇帝欣然欽定，城步縣的楊氏宗祠正式更名為“楊氏官廳”。匾額掛牌之日，前來上官村道喜的官員多達數百人。
其時京涼村一世祖楊正修的墓地紅地毯綿延數百米，從山腳下一直鋪到了墳臺前，場面頗為壯觀，乃大明開基以來楊家將的最大幸事。
楊喬然在南明的軍事和政治地位不斷上升，引來不少人的嫉恨，鎮守武岡的總兵何騰蛟和副總兵“劉鐵棍”劉承最為典型。二人是姻親，行軍打仗什么都不懂，爭權奪利倒是很在行，企圖一手遮天，挾持皇帝，此所謂外斗外行、內斗內行也。
劉鐵棍有軍隊二萬人，大多是南京的流氓、地痞組成。1646年，南明隆武帝封他為定蠻伯，更加驕橫不法。兵科給事中龔善選因公事路過武岡，他竟然讓士兵侮辱龔善選。
湖廣巡撫何騰蛟憑著三寸不爛之舌成功招撫了李自成的部將李過、郝搖旗、袁宗第、王進才等及左良玉的舊部，另外號荊、襄十三家軍也投到隆武的旗幟下，因此何騰蛟居功自傲，打壓異己，暗中培植自己的勢力。
在福建被軟禁的朱聿鍵，收到楊喬然的密信，得知楊家將的軍事集團已經初具規模，有了一定的戰斗力，楊喬然希望隆武帝盡快擺脫鄭芝龍的掌控。
朱聿鍵大喜，就匆匆攜數千明兵從福州至延平，冒險來湖南與楊喬然匯合。楊喬然帶領楊家將集團的數萬精兵奔往湘贛邊境的吉水接應，做好了隨時迎駕的準備。
隆武二年（1646）8月22日凌晨，幾百個清軍穿上明軍的服裝，打著明軍旗號，直奔城門。汀州守軍以為是敗退下來的明軍，沒有仔細盤問，竟然打開了城門，放清軍進來了。
清軍一擁而入，對著守軍就是一通亂砍亂殺，朱聿鍵此刻才明白上當了，后悔不該沒有聽楊喬然的勸告。于是他拔出寶劍，率部和清軍廝殺在一塊，砍死了不少清軍。
終因寡不敵眾，朱聿鍵退入汀州城衙的大堂上，被清軍亂箭射死，同時遇難的還有其皇后曾氏、沈嬪、陳嬪和不滿月的皇子。
隆武帝一死，又爆發了所謂的皇位之爭，唐王朱聿的軍隊和桂王朱由榔的軍隊發生激戰，鷸蚌相爭，漁翁得利，清軍乘機攻占了廣州城，朱聿自殺身亡，廣東淪陷。
朱由榔離開肇慶再度逃入廣西，留守肇慶的明兩廣總督朱治澗、梧州守將陳邦傅均棄城而逃，皇帝都逃跑了，還期盼手下賣命，朱由榔簡直是癡心妄想了，
1647年2月，清軍進攻桂林，劉承聲稱桂林守將瞿式耜與清廷勾結，迫使桂王赴全州，企圖挾永歷帝歸武岡。在全州，劉承根本就不把桂王放在眼里，好像他就是朱由榔的大救星一般，盛氣凌人，非常傲慢無禮。
楊喬然看不過作威作福的劉鐵棍，乃道：“劉鐵棍，注意君臣之禮，不可胡來！”
劉鐵棍竟然辱罵都御史楊喬然：“睜開你的眼睛看看我是誰，小心我揍扁你！”揮拳相向，將把人家的帽子衣服都撕破了。
侍衛張喜良拔出劍，欲砍殺劉鐵棍。為了顧全大局，再加之此刻身邊沒有帶多少兵，楊喬然及時阻止了張喜良。而后，楊喬然閉門不出，請求桂王解除劉鐵棍的兵權，歸自己節制。
逃跑冠軍朱由榔優柔寡斷，依舊我行我素，他天真的以為劉鐵棍的能力遠遠超過楊喬然，沒有聽取楊喬然的建議。
三月，永歷帝遷都武岡，楊喬然上書朱由榔盡快進入城步縣山區，楊家將可以保證他的安全，昏庸的朱由榔卻道：“城步縣乃山區也，朕不習慣！”以岷王府為行宮，封劉承為武岡候，氣得楊喬然差不多要吐血了。
但是群臣懾于劉鐵棍的淫威，爭相討好，上疏稱其功德。于是劉鐵棍被封為興國公上柱國，賜尚方寶劍，他又請封其弟劉承永為武岡伯，朱由榔也準允了，自此劉承越發專橫跋扈。
醉生夢死的朱由榔不思進取，將楊喬然撇在一邊，不準他的家族軍隊進入武岡轄地，否則就以謀反論處。清軍接連攻破常德、寶慶，直逼武岡城。
大隊清軍突然出現武岡州的南部，明軍大駭，不戰自亂，城南失守，大隊的明軍聞風從北門棄城逃跑。八月十三日，清兵破武岡，劉承以城降。
永歷帝跑得最快，連皇后、兒子、小姨子、母親都不要了，這時他才想起了楊喬然，迅速逃亡城步縣。
劉承帶著五、六萬人投降后，積極參加清剿南明勢力的軍事行動，這個作惡多端的流氓，最終被清軍以詐降的理由包圍，全部處死，罪有應得。
永歷帝過了木瓜橋后，在逃往城步的小路上迷失了方向，楊喬然的幾萬大軍在牛市橋等了足足一天，也沒有見到朱由榔的影子，遂撤離了。
閣臣吳炳奉命護衛皇長子往城步逃跑，等他趕到城步縣城時，楊喬然已經退往十萬古田了，縣城城已為清軍所占，一行人被俘虜，押送至衡陽。吳炳絕食，整理衣冠，北拜君親，捧敕誥自縊而死。
朱由榔沿著大道竟然沒有遇到清軍，一路跌撞撞撞、灰頭土面到了靖州，誤打誤撞總算見到楊喬然的飛山族人，其時已是九月初一。
在飛山族人軍隊的護送下，轉往柳州，這次算是福大命大，朱由榔見到了楊喬然，喜極而泣：“楊愛卿，朕執意不用楊家將，大錯特錯也！”
楊喬然啞然，不知道說什么才好。1649年，成事不足敗事有余的何騰蛟率軍數十萬在攻打長沙，指揮不當，兵敗被俘，自殺身亡，一手斷送了復湘援贛的戰略大局。自此，南明的精銳喪失殆盡，被清軍處處追著打。
永歷政權控制的云南、貴州、廣西、湖南、江西、四川、廣東7省的區域危機四伏，清軍的魔爪正一步步逼近。朱由榔不得已，此時才讓楊喬然出來擔任川南總督，出身將門之后的楊喬然義不容辭，帶著他的楊家軍子弟東征西討。
山河破碎，風雨飄搖，大廈即傾，楊喬然他能夠獨撐危局嗎？他有回天之力嗎？他的楊家將集團能否力挽狂瀾嗎？只有天知道了。
不久以后，楊喬然臨危受命，擔任川南總督，直接去了四川。清軍的暴行激起了漢族地區人民的強烈不滿，楊喬然借機與大西軍的孫可望、李定國以及李自成的大順余部取得了聯系，南明王朝于是和這些反清武裝結成了同盟，反清大業又有了新的起色。
1652年，孫可望在掌握南明大權后，以貴州為基地，向清軍發起了新一輪的攻擊，由大西軍改編過來為主體的明軍一路所向披靡，抗清武裝長驅直入，進入湖南、廣西、四川等地。
川南總督楊喬然給西寧王李定國提供了精準的軍事情報，并調2萬楊家軍協助進攻，胸有成竹的李定國率領的三萬精兵，殺回湖廣。
驍勇善戰的楊家軍編入軍中，李定國信心大增，湖南大部分失地被明軍占領。楊喬然建議南下廣西，直趨桂林，干掉叛徒定南王孔有德，打擊囂張的清軍，李定國欣然同意，立即采納了楊喬然的計策。
