在林子平等人物的串聯之下，不滿幕府統治的薩摩藩和長州藩形成了薩長同盟，土佐和肥前比較傾向于薩長同盟，但是并未直接提出加入該同盟之中。薩長同盟厲兵秣馬，積蓄實力，也引起了幕府方面的注意。
不過將軍德川家齊對于政治并不感興趣，雖然將軍的權力仍舊極大，但家齊卻更多把時間用在了女人的肚皮上面。家齊擁有四十位側室，并生育了五十五個子女，這還只是他在籍的子女，而私生兒女而是數不勝數了。
老中松平定信則認為薩摩藩和長州藩只是故作玄虛，根本不可能真的起兵對付幕府。松平定信對兵事不甚知曉，自認幕府軍和其他親藩的藩兵實力要大過薩長同盟，所以也沒有真的放在心上。
直到1790年5月，光格天皇在尊王勢力的支持下，于京都發動宮廷政變，發布“王政奉還令”，宣布成立新政府，解除了幕府親衛的武裝，同時薩長同盟的藩兵進入京都，控制了近畿形勢。
將軍德川家齊在得知光格天皇發布王政奉還令之后大怒，先是以清君側的名義發布《討逆表》，然后立即調遣幕府軍，會同津、桑名等藩的藩兵，準備攻打京都，徹底平息這場動亂。
不過倒幕派也是十分狡猾，他們一方面散播假消息，說倒幕派得到了大唐的支持，大唐隨時都可能從奧羽出兵，水陸并進，攻打關東；另一方面，與林子平齊名的進步人士高山彥九郎帶人潛入幕府統治的腹地，在江戶等地進行了敵后破壞，擾亂治安，阻礙幕府軍的出動。
德川家齊也是有些緊張，不僅江戶接連抓捕了搗亂分子和宣傳王政奉還的人，而且他無法拿定唐人是什么態度，即便派遣家臣前往大唐使館詢問，大唐方面也沒有給出任何的明確答案，既沒有說支持薩長一方，也沒有說支持幕府，這更讓德川家齊疑竇叢生。
也是由于這方面的顧慮，德川家齊不肯將自己的主力全部派出去對付薩長同盟，而是留下了相當一部分軍力鎮守江戶城，謹防唐人的偷襲。同時幕府的海軍的新式戰艦也不敢派到瀨戶內海去，這也是對大唐海軍的防備。
就是在這種掣肘下，幕府方面不能集中力量去迎戰倒幕派的軍隊，而且幕府方面由于對于倒幕派力量估計不足，而且認為他們不足一笑，所以準備也是非常不充分的，這也給了薩長同盟以可趁之機。
在幕府軍尚未準備完全妥當之時，倒幕軍組織了大約六千兵力，越過了伊吹山，奇襲了幕府軍的后路。是役，倒幕軍夜襲完全沒有準備的幕府軍和桑名藩的藩兵，并且秘密挖掘地道，并用炸藥炸開了名古屋城的城墻，奪取了尾張藩的居城，使得幕府大為震動。
可以說倒幕軍在戰略上這個敵后穿插，非常有唐軍作戰的風采，這也跟薩長同盟新式軍隊都受過唐人教官的訓練有關系，倒幕軍通過名古屋之戰，將幕府軍切割成了兩個部分，幕府的主力仍在關東，而另一部分則駐守在大阪，不能相互支援，特別是大阪方面，情況更加危機。
將軍德川家齊慌亂之中也顧不得什么防備唐軍了，急忙調動大量幕府軍和親藩兵力，企圖奪回信濃和尾張，打通前往近畿和關西的通路。而倒幕軍也集結大軍，準備借助從大唐進口的重炮，攻破重鎮大阪，徹底掌握住這場戰爭的勝勢。
于是，戰爭變成了幕府軍匯聚力量猛攻尾張和信濃，而倒幕軍則在猛攻大阪，雙方各自處于一攻一守的情況。如果幕府軍首先收復信濃和尾張，那么倒幕軍的形勢就會發生逆轉；如果倒幕軍能夠率先攻克大阪，那么整個關西的大名都會恭順于新政府，倒幕軍力量大增，足以對幕府進行最后一擊。
遠在洛杉磯的白南，并沒有預料到日本的形勢變化這么劇烈，一個月的時間內，日本國內已經狼煙四起，倒幕軍跟幕府軍已經戰成一團了。
在總統辦公室中，秘書齊愿為白南整理著來自各方的資料，說道：“根據我們情報部門和智庫的分析判斷，雖然幕府軍方面兵力占據優勢，但是松平定信的改革還是對幕府軍的戰斗力造成了不小的影響，尤其幕府的財政這幾年比較緊張，部隊裝備更新的工作幾乎停滯。而薩長同盟這邊，由于不斷地擴大與我們的貿易，所以收入還算不錯，并且采購了一系列優勢武器列裝部隊，名古屋之戰中，射速更快、火力更強的倒幕軍除了靠出其不意擊敗了幕府軍，裝備上的優勢也是不容忽略的。雖然幕府奪回名古屋的決心很大，但是薩長一方還能夠穩定地支持前方的作戰，而大阪的幕府軍也只不過是負隅頑抗。我們判斷只需要兩到三周的時間，幕府軍就會再次遭受全面的失敗，薩長同盟極有可能連同其他藩，組建一個以光格天皇為首的新政權。”
白南點點頭，捏著下巴沉思了一會兒。很顯然，大唐打開了日本的國門，給日本帶來了既有正面的影響，也有負面的影響，不過日本人抓住機會的能力還是很強的。如果大唐放任日本這個走勢，很有可能，一個類似明治政權的新日本政府就會出現。雖然這個位面中日本所面臨的條件要比明治那個時期差很多，強大的大唐就在身旁，而且很多條件都有限制。但是一個過分獨立，有著自己行動主張的日本，絕對不是大唐希望看到的。
根據歷史的慣性，只要日本這個國家強大起來了，必然走上一條對外擴張的道路，大唐倒是不擔心奧羽海外領被日本人奪回，白南卻有些擔心日本將會再次把主意打到朝鮮半島上去。雖然此時大唐在朝鮮半島并沒有太多利益，主要還是進行貿易，也并未進行控制，但一個野心膨脹的日本，對大唐總不是一件好事。
