就在楚軒雙手傷勢痊愈的幾天之后，赤木律子博士告知了楚軒一個“意外事件”的發生。.
“被封印在伯大尼基地用于研究的第三使徒逃脫，雖然被EVA臨時五號機擊破，但卻與五號機一同自爆了。”
在午間休息的空檔里，端著一杯咖啡主動找了過來的赤木律子博士語氣平靜地對楚軒說道。
“第三使徒？原來使徒已經再次出現過了嗎。”
楚軒面無表情地推了下反光的眼鏡，好像自言自語似的說道。
因為這里并非EVA原本的世界，而是“機戰世界”，所以NERV成立的原因、使徒出現的原因，還有那SEELE當作預言書來對待的《死海文書》，都有些微妙的不同。
根據楚軒的調查，在這個并沒有發生過“第二次沖擊”的世界里，第一使徒——也就是“亞當”，還有第二使徒、“亞當”的第一個妻子“莉莉絲”，應該都是以古化石之類的形態被某宗教機構所贊助的考古組織發現的。
而在該機構對“亞當”的后續研究還沒有展開的時候，天頂星人和星際異蟲就先后出現在了人類的視線里，于是該機構對“亞當”的研究計劃就又延后了——不過這反而是他們的運氣。
從EVA的“原作”中可以得知，“第二次沖擊”的真相乃是：
公元2000年，某個機構對位于南極大陸深層的“白之月”中的“亞當”進行接觸實驗的時候，因實驗情況失去控制，導致正在“白之月”中沉睡的“亞當”蘇醒并釋放其力量，引起南極地區大爆炸、海平面上升、地軸偏轉、大部分地區季節發生變化。
倘若不是因為歷史在2000年之前發生了巨大的轉折，倘若不是因為該機構在研究“亞當”之前，又獲得了一些關系的實驗成敗的天頂星人科技，到了該機構開始研究“亞當”的時候，“第二次沖擊”仍舊是不可避免的。()
——當然，或許在這個“機戰世界”里，“劇情”不是這樣展開的，或許該機構研究亞當出現意外也不會導致“第二次沖擊”這樣的全球姓的災難，而是會引發一個局部姓的災難，并開始各種機器人聯手對抗為了與“亞當”接觸而陸續前來地球的“使徒”的劇情。
從楚軒現在所掌握的信息來看，大概接下來的劇情差不多也就會是這樣的了：
雖然SEELE安全地完成了對“亞當”…應該還有“莉莉絲”的研究工作，但是因為一直封印“亞當”的朗基努斯之槍被拔下來了，仍然活在地球的某處或地球附近的太空中的“使徒”紛紛收到了“亞當”發出的信號，于是便前去接觸“亞當”，將自身的生命形態“補完”。
——按照制造了長門有希的資訊統合思念體的說法，就是自身的進化已經陷入了停滯狀態的生命體，為了尋找自律進化的可能姓，而試圖獲得其“遠祖”所攜帶的信息資訊。
而第十八使徒“李林”，也就是人類之中，也有這樣一部分知情者試圖爭奪這個補完的機會——那就是“SEELE”這個組織的高層。
但不管他們是想要“代表”全人類爭奪補完的機會，還是因為覺得人類無論怎么發展，也不可能打敗連包括天頂星人在內的無數比人類更先進的宇宙文明都只能落荒而逃的星際異蟲，所以想要另辟蹊徑…甚至是提前集體自殺，他們的目的都不可能公之于眾，只能在暗地里進行。
——就算每個人都知道自己今后必定會滅亡，但是對于每一個個體都擁有自己的讀力意志的人類來說，自己走向死亡和被迫放棄自己的讀力意志是截然不同的，沒有多少人會同意實施什么“人類補完計劃”。
就連NERV這個組織里，絕大多數人也根本不知道SEELE的真正目的，在這一點上SEELE做得比起《進擊的巨人》世界里那個極端宗教環保組織可差得多了。
起碼那個組織里的絕大多數人都很清楚自己是在做什么，而且堅定地相信著自己這樣做是為了保護環境，也是為了保護人類自身，而SEELE卻連這種與自己擁有共同信念的“同志”都找不到多少，甚至連不夠他們組建全都是由“同志”所組成的NERV。
不…也許SEELE將自己的“同志”們全都派遣到了各個秘密研究機構之中，只有在NERV這個公開活動的，很有可能被各個國家和組織安插間諜的執行機構里面才大量啟用了被蒙在鼓里的“外人”。
——其中也包括了楚軒。
“嗯，《死海文書》中記載的第三使徒其實已經被我們從永久凍土中發掘了出來，不過為了避免引起普通民眾的恐慌，所以我們一直沒有公布這一信息，而是秘密地對其進行了研究。
——其實這也是因為當時大家的視線都集中在了‘天頂星人’、‘異蟲’，以及天頂星人所描述的其它宇宙文明這種非常‘科學’的東西上了，一開始根本沒有幾個人相信《死海文書》這種和‘科學’沒有半點關系的宗教典籍中的預言會變成現實，所以SEELE才只能獨自進行著對付‘使徒’的準備。
正是通過對第三使徒的研究，我們才獲得了許多關于使徒的第一手情報，這是《死海文書》中所沒有的。
而且倘若不是SEELE用事實證明了‘使徒’這種東西是存在的，NERV的組建也不會得到其它國家和組織的理解和支持——雖然他們仍然不認為‘使徒’是神的仆人，而是將它們當作了一種在遠古時期曾經來到過地球的外星文明遺留下的生物戰斗兵器。
不過我個人也是化身于這種認識的，畢竟我首先是個科學家，其次才是NERV的研究人員嘛。”
赤木律子的話雖然是真的，但她卻用了楚軒這類智者最常用的手段，那就是只敘述一部分真相，并利用這部分真相將別人的思維引向他們需要的道路上去。
當然，赤木律子自己應該也不知道“人類補完計劃”的真相，但是“亞當”和“莉莉絲”的存在她絕對不會不清楚，不過她卻沒有將第一和第二使徒的真相告訴楚軒。
而在可以公開的《死海文書》上，第一使徒“亞當”和第二使徒“莉莉絲”早就已經灰飛煙滅，又或者是“幸運”地成為化石了；第三使徒及以后的使徒則不同，它們是即將按照預言，陸續出現在“世界末曰”到來的地球上毀滅罪人的天使。
至于NERV成立的目的，也不是配合“使徒”凈化地球，而是對抗神所派來的滅世天使們，保護地球、保護人類，因此他們才會在NERV的標志上寫下“Godisinhisheaven,allsrightwiththeworld.”
“神居于天，天下太平”，這其實就是說上帝你老人家只要乖乖地在天上保佑人類就可以了，只要你老人家別派滅世天使下來搗亂，天下就太平了。
當然，既然現在已經天下太平了，那么上帝這個老糊涂所派來的滅世天使自然就是“非法”的，人類就必須拿起武器來捍衛自己“合法”生存在這世間的權利，哪怕要將武器對準神的使徒也一樣。
為了完成這一目的，他們才將“亞當”重新從化石里挖了出來，并關到了人類迎擊“使徒”的要塞——第三新東京市地下基地最深處的“中央教條”之中，以此引誘必須和“亞當”接觸才能夠發動“第二次沖擊”的使徒在人類所選定的戰斗地點對人類戰斗。
這樣一來，不知道具體哪一天會出現的使徒所占據的就只有“天時”而已，但人類卻同時占據了“地利”與“人和”這兩條，勝算就又增加了一些。(
